Дело в том, что при легализации документов Министерство юстиции заверяет подпись нотариуса. Если какого-то нотариуса в базе данных Министерства не окажется (чего в случае с исполняющим обязанности нельзя исключить), запрос отправляется в нотариальную контору, а это может оказаться долгой историей. Поэтому лучше стараться заверять документы для легализации непосредственно у нотариуса.